پیش از هر نوع هرس، مشخص کنید که نوع گیاه اصلاح شده است یا اصلاح نشده. در گیاهان اصلاح نشده باید آن‌ها را به یک چوب ببندید تا سرپا بمانند و مرتب هرس کنید. در حالی که گیاهان اصلاح شده به صورت بوته‌ای رشد کرده و با انتقال مواد مغذی به گیاه اصلی، به هرس چندانی نیاز ندارند.
ساقه‌ها را بررسی کنید. معمولاً در بین تنه و شاخه‌های گیاهان اصلاح نشده، جوانه‌های کوچکی پدیدار می‌شود. این جوانه‌ها سپس ساقه نامیده شده و باید هرس شوند. در صورتی که هرس نشوند انرژی گیاه را گرفته و باعث تولید گوجه فرنگی‌های کمتر خواهند شد. اگرچه این ساقه‌ها ضرر چندانی ندارند اما به طور کلی بریدن آن‌ها باعث افزایش تعداد گوجه‌ها در یک فصل خواهد شد.
گل‌ها را بررسی کنید. بهتر است هر چه زودتر و به محض شکوفه کردن گیاه، آن را هرس کنید. در این زمان اندازه گیاه باید ۳۶ و ۵۴ باشد.
نوک گیاه را هرس کنید. برای دریافت بهترین نتیجه از فصل رویش گیاه، باید نوک گیاه را هرس کنید. حدود یک ماه پیش انجماد گیاه یا زمانی که گیاه به سقف گلخانه رسید، جوانه انتهایی را هرس کنید. در این موقع از فصل، گوجه فرنگی‌ها برای رسیده شدن زمان کوتاهی دارند، بنابراین تمام مواد مغذی گیاه باید به گوجه‌ها برسد.